Заместитель Мэра Москвы в Правительстве Москвы по вопросам межрегионального сотрудничества, массовых коммуникаций, спорта и туризма с октября 2008 г., до этого - префект ЦАО.
Отмечен за следующее:
В сентябре 2008 года в «Лужниках» появился первый в столице веломаршрут!...Согласно программе префектуры ЦАО по развитию велосипедного транспорта, экспериментальный веломаршрут проложен от станции метро Воробьевы горы по Лужнецкой набережной, с заездом на Аллею славы спорткомплекса.
У Сергея Байдакова были и дальнейшие планы по развитию велосипедной инфраструктуры, но он получил новое назначение. Сменивший же его на посту префекта ЦАО Алексей Александров решил велодорожки пока не строить.